Il boom del sequenziamento da 1,75 miliardi di dollari del CDC potrebbe gettare soldi nel problema sbagliato

spesa per il sequenziamento del covid

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  • Il Congresso sta pompando fondi nella sorveglianza genomica CDC, statale e locale
  • Alcuni stati stanno raggiungendo l'obiettivo di esaminare il 5% dei test positivi per nuove varianti
  • Ma la maggior parte dei vantaggi sarà a lungo termine e le norme sanitarie statunitensi rendono quasi impossibile il monitoraggio a livello di paziente

Poco dopo l'insediamento del presidente Biden, l'uomo a cui era stato dato il comando della sua risposta al coronavirus aveva un messaggio su ciò che l'America doveva fare. Siamo al 43° posto nel mondo nel sequenziamento genomico, ha affermato Jeff Zients in una conferenza stampa a gennaio . Totalmente inaccettabile.

La risposta, ha suggerito, era di eseguire la quantità appropriata di sequenziamento genomico, che ci consentirà di individuare precocemente le varianti, il che è il modo migliore per affrontare qualsiasi potenziale variante.

Gli scienziati hanno sequenziato i genomi dei campioni di covid sin dal primo caso identificato a Wuhan; i primi vaccini mRNA sono stati costruiti utilizzando il codice genetico rilasciato pubblicamente da scienziati cinesi a gennaio. Ed è stato fatto su una scala senza precedenti. A metà dicembre, 51.000 genomi covid dagli Stati Uniti era già stato decodificato e pubblicato in archivi pubblici. È sette volte il numero di campioni di influenza sequenziati ogni anno dai Centers for Disease Control and Prevention.



La stragrande maggioranza del sequenziamento covid in America è stata condotta nei centri accademici. Ciò è dovuto principalmente al fatto che fino a poco tempo fa era considerata un'attività accademica, tenere traccia dei cambiamenti in un virus ampiamente ritenuto evolversi lentamente e costantemente.

Cosa è andato storto con il sistema di dati sui vaccini americano da 44 milioni di dollari? Il CDC ha ordinato un software che avrebbe dovuto gestire il lancio del vaccino. Invece, è stato afflitto da problemi e abbandonato dalla maggior parte degli stati.

Anche a novembre e dicembre, sia come Regno Unito che Sud Africa ha annunciato ceppi più trasmissibili e La Danimarca ha detto che ucciderà 15 milioni di visoni per contenere una mutazione, molti scienziati e organizzazioni di salute pubblica hanno sostenuto che era improbabile che il virus sfuggisse all'immunità indotta dal vaccino.

Tuttavia, come avvertivano i titoli coronavirus mutante diffusione fuori controllo , i politici e il pubblico hanno chiesto di sapere se c'erano varianti di preoccupazione nei loro stessi cortili.



Data la piccola frazione di infezioni statunitensi che sono state sequenziate, la variante potrebbe essere già negli Stati Uniti senza essere stata rilevata, ha risposto il CDC, in una nota pubblicato in linea .

L'America sta volando alla cieca è diventato rapidamente un ritornello, non solo per gli scienziati in cerca di supporto per il loro lavoro, ma per i critici della risposta degli Stati Uniti alla ricerca di un problema risolvibile. Una certa frustrazione è stata sicuramente guidata da messaggi imprecisi: il 22 dicembre, ad esempio, Lo riporta il New York Times quello meno di 40 genomi covid era stato sequenziato negli Stati Uniti dal 1° dicembre. In realtà, i laboratori statunitensi hanno inviato quasi 10.000 nuove sequenze a repository pubblici in quel periodo.

Il sostegno finanziario e politico è arrivato rapidamente sotto la nuova amministrazione, con i CDC 200 milioni di dollari di acconto per il lavoro in sequenza. Quindi il disegno di legge di soccorso approvato a marzo ha dedicato 1,75 miliardi di dollari strabilianti per sostenere i programmi di salute pubblica a livello nazionale che sequenziano malattie o infezioni, incluso il covid-19.



Il CDC e l'OMS hanno fissato l'obiettivo di sequenziare il 5% dei casi positivi di covid per monitorare la diffusione delle varianti. Gli Stati Uniti hanno rapidamente raggiunto questo obiettivo, principalmente pagando laboratori di test privati ​​​​per sequenziare un piccolo numero di campioni positivi.

Il CDC e l'OMS hanno fissato un obiettivo di sequenziando il 5% dei casi positivi per tenere traccia della diffusione delle varianti, un numero basato su uno studio pre-stampa del produttore dominante di sequenziatori covid, Illumina.

Gli Stati Uniti hanno rapidamente raggiunto questo obiettivo, principalmente pagando laboratori di test privati ​​​​per sequenziare un piccolo numero di campioni positivi. Nell'ultima settimana di marzo, quando sono stati segnalati 450.000 nuovi casi, i laboratori statunitensi, compresi i laboratori accademici finanziati attraverso altri programmi, hanno inviato 16.143 sequenze anonime a GISAID, un repository globale di dati biologici, e 6.811 al National Center for Biotechnology Information, o NCBI.



(Quel periodo ha visto uno dei tassi di casi più bassi in sei mesi, tuttavia; per sequenziare il 5% durante il picco di gennaio, i laboratori statunitensi avrebbero dovuto spendere ben oltre un milione di dollari al giorno per sequenziare cinque volte il numero di campioni.)

L'America dovrebbe essere un luogo eccellente per studiare l'evoluzione genetica del covid. Ha infezioni diffuse, una popolazione geneticamente diversificata e il maggior numero di individui vaccinati al mondo. Ma nonostante l'aumento del sequenziamento genomico, alcuni esperti di salute pubblica e scienziati ora si chiedono cosa si stia facendo con tutte queste informazioni e quanto siano realizzabili gli obiettivi del campo.

Sul suo sito che descrive la sorveglianza genomica, il CDC afferma che il sequenziamento può tracciare se le varianti hanno imparato a eludere i vaccini o i trattamenti. Ma il programma di sequenziamento della sorveglianza dell'agenzia non collega nessuna delle sue sequenze alle persone da cui provengono, se sono state vaccinate o quanto si sono ammalate.

L'argomento principale a favore di questo tipo di sequenza di sorveglianza anonima, nel frattempo, è che avvisa i funzionari in anticipo sui potenziali cambiamenti nelle percentuali dei casi. Ma in risposta alla notizia che in America sono ben consolidate varianti trasmissibili, gli stati hanno allentato i mandati delle maschere e riaprendo i pasti al coperto.

Abbiamo parlato con un certo numero di esperti di sequenziamento con esperienza diretta durante la pandemia e abbiamo sentito lo stesso da molti di loro: trasformare i dati di sorveglianza in conoscenze utili deve affrontare enormi barriere legali, politiche e infrastrutturali negli Stati Uniti, alcune delle quali insormontabili.

A meno che scienziati e politici non chiedano perché vogliono sequenze covid e come utilizzare al meglio quei dati, la sorveglianza genomica produrrà rendimenti decrescenti e molto del suo potenziale sarà probabilmente sprecato.

È follemente difficile farlo bene negli Stati Uniti, afferma Lane Warmbrod, analista senior presso il Johns Hopkins Center for Health Security. Sarei molto deluso se tutti questi soldi andassero a ottenere un sacco di sequenze covid e nessun pensiero andasse a costruire qualcosa che duri.

Cosa non può fare il sequenziamento della sorveglianza

Non c'è dubbio che il sequenziamento sia stato rivoluzionario per la salute pubblica, anche perché i vaccini mRNA sono stati sviluppati utilizzando sequenze rese pubbliche appena un mese dopo che un uomo si è presentato all'ospedale di Wuhan con una strana malattia.

Il sequenziamento della sorveglianza, che identifica il codice genetico di una parte dei test positivi e cerca i cambiamenti nel tempo, può aiutare i ricercatori a tenere traccia dell'evoluzione del virus. Se un ceppo aumenta più velocemente di altri, i ricercatori possono puntare su di esso per ulteriori indagini.

La nostra sorveglianza è imperfetta, ma siamo in grado di vedere quando e dove stiamo ricevendo la trasmissione in una regione e identificare modelli di cambiamento su larga scala, afferma Duncan MacCannell, chief science officer dell'Office of Advanced Molecular Detection, o OAMD, l'ufficio del CDC responsabile dell'espansione degli sforzi di sequenziamento nazionale.

Quando viene chiesto perché il sequenziamento della sorveglianza è così importante, è normale che le autorità rispondano che può aiutare a tenere traccia del comportamento di un ceppo nel mondo reale. Spesso, tuttavia, tali argomenti confondono due cose: campionamento di test positivi che sono stati resi anonimi e utilizzo di analisi mirate per comprendere casi specifici e identificabili.

Il La pagina del CDC sul sequenziamento della sorveglianza delle varianti covid , ad esempio, afferma che l'analisi di routine dei dati della sequenza genetica può aiutare a rilevare varianti con la capacità di eludere l'immunità naturale o indotta da vaccino e causare malattie più lievi o più gravi nelle persone.

'Solo perché vedi una variante più spesso, significa che in realtà è più trasmissibile? Forse. Abbiamo bisogno di fare più scienza per capire se sta facendo qualcosa di cui siamo davvero preoccupati.

Sapere quando le varianti imparano a eludere il sistema immunitario può dire agli scienziati se hanno bisogno di cambiare le formule del vaccino. Ma le sequenze non possono dirti queste cose a meno che non siano collegate alle informazioni sulle persone da cui provengono. Questo è spesso impossibile secondo le normative statunitensi.

Solo perché vedi una variante più spesso, significa che in realtà è più trasmissibile? Forse, dice Brian Krueger, direttore tecnico di ricerca e sviluppo presso LabCorp, che ha un contratto di sequenziamento covid con il CDC. Abbiamo bisogno di fare più scienza per capire se sta facendo qualcosa di cui siamo davvero preoccupati.

Quel contratto LabCorp fa parte del programma di sequenziamento primario di OAMD, che paga grandi laboratori di test in tutto il paese per sequenziare migliaia di test covid positivi. Il progetto è principalmente alla ricerca di varianti preoccupanti, ceppi già sospettati di causare esiti peggiori o di diffondersi più rapidamente. Sta anche monitorando quando e dove si stanno diffondendo diversi rami dell'albero genealogico di covid-19 e quali cambiamenti genetici si verificano ripetutamente. Se un ramo del virus cresce più velocemente di altri, o una mutazione continua a manifestarsi in famiglie diverse, può essere segnalata per l'attenzione.

Allo stesso tempo, l'OAMD sta raccogliendo campioni grezzi dai laboratori di salute pubblica in tutto il paese per studiarli in laboratorio, coltivare i campioni virali nei piatti e confrontarli con le terapie e gli anticorpi dei pazienti. Questi studi in provetta sono la fonte dei titoli più recenti sulle varianti che aggirano la protezione conferita dai vaccini. Tendono anche a svendere drasticamente la protezione immunitaria contro le malattie, che ha molti meccanismi sovrapposti.

Ma a causa della privacy del paziente e di altri requisiti posti in essere per il controllo normativo, tutti questi campioni, così come tutte le sequenze che raccolgono dai laboratori, vengono deliberatamente anonimizzati: non hanno alcun collegamento con il paziente in questione.

Prendendo la vista di 10.000 piedi

Secondo MacCannell, l'OAMD non ha intenzione di contestualizzare i suoi dati anonimizzati con informazioni cliniche.

Quei contratti sono impostati per darci una visuale di 10.000 piedi, afferma MacCannell.

Anche se volesse combinare le sequenze di sorveglianza con le informazioni sui pazienti nelle sue analisi, l'agenzia starebbe combattendo un'enorme battaglia in salita. Negli Stati Uniti, la maggior parte delle cartelle cliniche dei pazienti (risultati dei test, informazioni sulle vaccinazioni, cartelle cliniche ospedaliere) sono sparse in molti database non collegati. Indipendentemente dal fatto che i proprietari di tali dati siano interessati o meno a consegnare le informazioni al governo, la loro raccolta richiederebbe in genere il consenso di ciascun individuo, un'impresa molto laboriosa.

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Invece di cercare di risolvere questi problemi a livello nazionale, i contratti di sequenziamento consentono alle singole agenzie di sanità pubblica di richiedere i nomi e le informazioni di contatto delle persone che sono risultate positive per varianti preoccupanti. Ma questo spinge solo gli stessi problemi di proprietà dei dati lungo la catena.

Alcuni stati sono molto bravi e vogliono sapere molto sulle varianti che circolano nel loro stato, afferma Brian Krueger di LabCorp. Gli altri stati no.

Gli epidemiologi della salute pubblica spesso hanno poca esperienza con la bioinformatica, utilizzando software per analizzare grandi set di dati come le sequenze genomiche. Solo poche agenzie hanno programmi di sequenziamento preesistenti; anche se lo facessero, il fatto che ciascuna giurisdizione analizzi solo una piccola fetta del set di dati riduce la quantità di conoscenza che può essere raccolta sul comportamento nel mondo reale.

Tuttavia, aggirare questi problemi, semplificando la connessione di sequenze e metadati clinici su larga scala, richiederebbe qualcosa di più della semplice riforma radicale delle normative sulla privacy. Significherebbe una riorganizzazione dell'intero sistema sanitario negli Stati Uniti, dove ciascuna delle 64 agenzie di sanità pubblica operano come feudi, e non c'è centralizzazione dell'informazione o del potere.

I metadati sono il singolo più grande dado non crackato, afferma Jonathan Quick, amministratore delegato della risposta alla pandemia, preparazione e prevenzione presso la Rockefeller Foundation. (La Rockefeller Foundation aiuta a finanziare la copertura al MIT Technology Review, sebbene non abbia una supervisione editoriale.) Poiché è così difficile per gli esperti di salute pubblica mettere insieme set di dati abbastanza grandi da comprendere davvero il comportamento delle varianti nel mondo reale, la nostra comprensione deve venire da produttori di vaccini e ospedali che aggiungono il sequenziamento ai propri studi clinici, afferma.

È frustrante per lui che esistano già così tanti enormi set di dati di informazioni utili nelle cartelle cliniche elettroniche, nei registri delle vaccinazioni e in altre fonti, ma non possono essere facilmente utilizzati.

C'è molto di più che potrebbe essere appreso e appreso più velocemente, senza le catene che mettiamo sull'uso di quei dati, afferma Quick. Non possiamo semplicemente fare affidamento sulle aziende produttrici di vaccini per la sorveglianza.

Potenziamento della bioinformatica a livello statale

Se ci si aspetta che i laboratori di salute pubblica si concentrino maggiormente sul tracciamento e sulla comprensione delle varianti da soli, avranno bisogno di tutto l'aiuto possibile. Dopotutto, fare qualcosa sulle varianti caso per caso è un lavoro di salute pubblica, mentre fare qualcosa sulle varianti a livello politico è politico.

I laboratori di salute pubblica generalmente utilizzano la genomica per esporre informazioni altrimenti nascoste su focolai o come parte di sforzi di tracciabilità. In passato, il sequenziamento è stato utilizzato per la connessione E. coli focolai in fattorie specifiche, identificare e interrompere le catene di trasmissione dell'HIV, isolare i casi di Ebola negli Stati Uniti e seguire i modelli influenzali annuali.

Anche quelli con programmi consolidati tendono a usare la genomica con parsimonia. Il costo del sequenziamento è diminuito drasticamente negli ultimi dieci anni , ma il processo non è ancora economico, in particolare per i dipartimenti sanitari statali e locali a corto di liquidità. Le macchine stesse costano centinaia di migliaia di dollari per l'acquisto e più per l'esecuzione: Illumina, uno dei maggiori produttori di apparecchiature per il sequenziamento, afferma che i laboratori spendono in media $ 1,2 milioni annualmente sulle forniture per ciascuna delle sue macchine.

Perderemo un sacco di opportunità se diamo solo soldi ai dipartimenti sanitari per impostare programmi senza avere una strategia federale in modo che tutti sappiano cosa stanno facendo.

Le agenzie sanitarie non hanno solo bisogno di soldi; hanno anche bisogno di esperienza. La sorveglianza richiede bioinformatici altamente qualificati per trasformare le lunghe stringhe di lettere di una sequenza in informazioni utili, nonché persone che spieghino i risultati ai funzionari e li convincano a trasformare le lezioni apprese in politiche.

Fortunatamente, l'OAMD ha lavorato per supportare i dipartimenti sanitari statali e locali mentre cercano di comprendere i loro dati di sequenziamento, impiegando bioinformatici regionali per consultarsi con gli ufficiali della sanità pubblica e facilitando gli sforzi delle agenzie per condividere le loro esperienze.

Sta anche riversando centinaia di milioni per costruire e supportare i programmi di sequenziamento di quelle agenzie, non solo per il covid, ma per tutti i patogeni.

Ma molte di queste agenzie stanno subendo pressioni per sequenziare il maggior numero possibile di genomi covid. Senza una strategia coerente per la raccolta e l'analisi dei dati, non è chiaro quanta utilità avranno quei programmi.

Perderemo un sacco di opportunità se diamo solo soldi ai dipartimenti sanitari per impostare programmi senza avere una strategia federale in modo che tutti sappiano cosa stanno facendo, afferma Warmbrod.

Visioni iniziali, usurpate

Mark Pandori è direttore del laboratorio di salute pubblica dello stato del Nevada, uno dei programmi supportati da OAMD. È stato un forte sostenitore della sorveglianza genomica per anni. Prima di trasferirsi a Reno, ha gestito il laboratorio di salute pubblica nella contea di Alameda, in California, dove ha contribuito a fare da pioniere a un programma che utilizzava il sequenziamento per tenere traccia del modo in cui le infezioni venivano trasmesse negli ospedali.

Trasformare le sequenze in dati utilizzabili è la sfida più grande per i programmi di genomica della salute pubblica, dice.

Il CDC può dire: 'Vai a comprare un mucchio di apparecchiature di sequenziamento, fai un sacco di sequenziamento.' Ma non fa nulla a meno che i consumatori di quei dati non sappiano come usarli e sappiano come applicarli, dice . Ti sto parlando della robotica di cui abbiamo bisogno per mettere in sequenza le cose ogni giorno, ma i dipartimenti sanitari hanno solo bisogno di un modo semplice per sapere se i casi sono correlati.

Quando si tratta di varianti, i laboratori di sanità pubblica sono sottoposti a molte delle stesse pressioni che devono affrontare i CDC: tutti vogliono sapere quali varianti stanno circolando, indipendentemente dal fatto che possano o meno fare qualcosa con le informazioni.

Pandori ha lanciato il suo programma di sequenziamento del covid sperando di ridurre il lavoro necessario per indagare su potenziali focolai di covid, identificando rapidamente se i casi catturati l'uno vicino all'altro fossero correlati o casuali.

Il suo laboratorio è stato il primo in Nord America a identificare un paziente reinfettato da covid-19, e in seguito ha trovato la variante B.1.351 in un uomo ricoverato appena tornato dal Sud Africa. Con il tracciamento rapido dei contatti, il dipartimento sanitario è stato in grado di impedirne la diffusione.

Ma i dipartimenti sanitari della contea hanno spostato le loro priorità da quelle indagini sul campo in risposta all'attenzione del pubblico sulla ricerca di varianti note di preoccupazione, dice. È una mossa di cui è piuttosto scettico.

La mia visione iniziale di usarlo come strumento di indagine epidemiologica e sulle malattie è stata usurpata usando questo come scansione variante, afferma Pandori. È una specie di nuova fase nei test di laboratorio. Siamo passati dal non avere abbastanza test, punto, al non avere abbastanza sequenziamento genetico, immagino. Questo è ciò che la gente sta dicendo ora.

(Pandori non è l'unico i cui interessi di ricerca sono stati ostacolati da un focus sulla sorveglianza. Krueger ha creato il programma di sequenziamento covid di LabCorp sperando di studiare come si evolvono le varianti all'interno dei singoli pazienti. La valuta in questi giorni sembra essere, quanti genomi completi puoi inviare ai diversi database? dice.)

Ogni mese, il laboratorio di Pandori invia 40 campioni al CDC, come richiesto. Il team sequenzia anche 64 dei propri campioni al giorno. Quando non hanno abbastanza campioni recenti, si immergono negli archivi; finora sono tornati ai campioni di novembre.

Per quanto riguarda il sequenziamento del 5% dei casi del Nevada, la maggior parte dei test nello stato è condotta da laboratori privati, che generalmente scartano i campioni prima che possano essere sequenziati. I campioni che vengono testati da laboratori privati, o test antigenici, quelli vengono persi per la sorveglianza, dice.

Pandori afferma di non aver sentito dal CDC o dal dipartimento di sanità pubblica dei dati sulle varianti del programma di laboratorio del CDC.

Fallo perché hai una domanda

Gli Stati Uniti possono incontrare difficoltà uniche nel collegare le sequenze varianti al loro comportamento nel mondo reale, ma ogni sistema deve affrontare le proprie sfide. Anche i paesi con sistemi sanitari nazionali ben sviluppati stanno lottando per litigare l'enorme quantità di dati necessari per capire davvero cosa stanno facendo questi cambiamenti genetici.

In effetti, ci sono pochi governi che svolgono il lavoro e forse solo uno lo fa con successo su larga scala.

COG-UK, un consorzio di laboratori accademici e governativi in ​​Gran Bretagna, ha organizzato il primo grande sforzo di sequenziamento del covid al mondo ed è ampiamente considerato la stella splendente del campo. I suoi scienziati non solo hanno sequenziato quasi il doppio dei campioni rispetto agli Stati Uniti, ma sono stati anche i primi a identificare e caratterizzare una variante con una maggiore trasmissione.

Fallo perché hai una domanda. In caso contrario, smetti di utilizzare tutti i nostri reagenti Illumina. Le nostre catene di approvvigionamento sono andate in malora da quando gli Stati Uniti hanno annunciato che avrebbero aumentato la capacità di sequenziamento.

Hanno fatto tutto per meno di 50 milioni di sterline (69 milioni di dollari), secondo Leigh Jackson, il project manager scientifico del consorzio. È piuttosto sbalorditivo confrontare i nostri costi con ciò che il settore privato addebita per questi tipi di servizi, afferma, osservando che la maggior parte del lavoro proviene da laboratori accademici, che addebitano loro principalmente i materiali.

In modo schiacciante, l'obiettivo numero uno sarà la consapevolezza delle mutazioni di fuga del vaccino nel mondo reale. Sta per succedere. Poiché ora abbiamo una copertura e una capacità così estese, dovremmo essere in grado di vederli abbastanza rapidamente, afferma Jackson.

Questo lavoro è possibile perché la salute pubblica e la medicina nel Regno Unito sono entrambe nazionalizzate, quindi i test e le registrazioni dei vaccini sono tutti etichettati con il numero NHS univoco dei pazienti. COG-UK ha bisogno solo di alcuni accordi di condivisione dei dati per collegare tutti i 400.000 campioni che hanno sequenziato agli elenchi dei vaccini e ai dati ospedalieri di primo livello. Questo non vuol dire che combinare questi set di dati sia facile; il gruppo sta attualmente costruendo un sistema semplificato per collegare insieme tutti gli altri sistemi disconnessi, automatizzando il caricamento di nuovi dati e facilitando l'accesso ai partner.

Jackson è felice di sapere dell'espansione di programmi di sequenziamento ben progettati, ma contesta il sequenziamento di massa eseguito senza obiettivi chiaramente definiti.

Non farlo perché è un vincitore del voto, o ha un bell'aspetto o rende felici le persone. Fallo perché hai una domanda, dice. In caso contrario, smetti di utilizzare tutti i nostri reagenti Illumina. Le nostre catene di approvvigionamento sono andate in malora da quando gli Stati Uniti hanno annunciato che avrebbero aumentato la capacità di sequenziamento.

Dal campione al E allora?

Nella sanità pubblica, a differenza della ricerca di base, la conoscenza è potere solo se accompagnata dall'azione. È ciò che Quick della Rockefeller Foundation chiama passando dal campione al 'E allora?'

Le sequenze devono essere collegate ai dati sull'immunizzazione su larga scala per dire qualcosa sull'efficacia del vaccino. I decisori devono rispondere alle varianti se il loro sequenziamento ha importanza. (In questo momento, molti stati degli Stati Uniti stanno riaprendo cinema e ristoranti al coperto, nonostante le prove evidenti che più ceppi trasmissibili stanno portando casi in tutto il paese.)

Il prossimo atto per l'RNA messaggero potrebbe essere più grande dei vaccini covid

I nuovi vaccini a RNA messaggero per combattere il coronavirus si basano su una tecnologia che potrebbe trasformare la medicina. Prossimo: anemia falciforme e HIV.

Warmbrod della Johns Hopkins spera che questo denaro venga utilizzato in modo proattivo, con un occhio al futuro, invece che in modo reattivo.

Quando torno indietro e guardo documenti che hanno sei, sette anni, è come, 'Oh Dio, sappiamo di questo problema esatto da anni e non abbiamo fatto nulla', dice. Qualunque sia lo strumento e l'infrastruttura che costruiamo ora, possono essere utilizzati per molto di più del semplice covid.

MacCannell pensa allo stesso modo: il nostro ruolo è davvero quello di capire come espandere la sorveglianza genomica in tutto il sistema sanitario pubblico statunitense in modi che non siano solo specifici del covid. Vogliamo prendere le lezioni apprese e applicarle ampiamente.

È a vantaggio di tutti se questa vasta iniezione di denaro viene utilizzata non solo in risposta a una crisi, ma in preparazione alla prossima. Offre una reale opportunità per riparare le crepe nel nostro sistema sanitario pubblico e costruire istituzioni stabili che colmino le disparità sanitarie, rispondano con forza a potenziali minacce e continuino a funzionare in caso di crisi.

Allo stesso tempo, se il CDC vuole sfruttare al meglio il suo ruolo di agenzia sanitaria pubblica nazionale, dovrebbe utilizzare tutte le risorse a sua disposizione, incluso questo enorme archivio di sequenze di varianti del mondo reale, per monitorare il mondo reale comportamento, come eludere l'immunità indotta dal vaccino.

Non farlo potrebbe avere conseguenze mortali.

Stiamo iniziando a immunizzare il pianeta e sono piuttosto preoccupato, dice Quick. Abbiamo bisogno di condividere questi dati in modo da non investire un'enorme quantità di tempo e sforzi nell'immunizzare quante più persone possibile, solo per scoprire che era molto meno efficace di quanto pensassimo. Ci sono più vite perse e più credibilità persa per i vaccini.

Questa storia fa parte del Pandemic Technology Project, supportato dalla Rockefeller Foundation.

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