Il motore di ricerca per malattie rare che supera Google

Alla fine degli anni '40, un professore della School of Medicine dell'Università del Maryland coniò una frase insolita per descrivere diagnosi inaspettate. Quando senti il ​​rumore degli zoccoli dietro di te, non aspettarti di vedere una zebra, ha detto. La frase è rimasta e oggi i medici usano comunemente il termine zebra per descrivere una malattia rara, solitamente definita come una malattia che si verifica in meno di 1 su 2000 della popolazione.

Le malattie rare sono intrinsecamente difficili da diagnosticare. Secondo l'Organizzazione europea per le malattie rare, il 25% delle diagnosi ha un ritardo tra i 5 ei 30 anni.

Quindi non sorprende che i medici siano alla ricerca di modi più efficaci per svolgere il lavoro. Un aiuto sempre più comune in questo processo è il motore di ricerca, tipicamente Google. Questo fa parte di un processo iterativo in cui un medico inserisce i sintomi in un motore di ricerca, esamina elenchi di potenziali malattie e quindi cerca ulteriori prove dei sintomi nel paziente.

Il problema, ovviamente, è che i motori di ricerca comuni non sono ottimizzati per questo processo. Google, ad esempio, considera importanti le pagine se sono collegate da altre pagine importanti, alla base del suo famoso algoritmo PageRank. Tuttavia, è improbabile che le malattie rare per definizione abbiano un alto profilo sul web. Inoltre, è probabile che le ricerche siano afflitte da ritorni da tutti i tipi di fonti irrilevanti.

Oggi, Radu Dragusin dell'Università tecnica della Danimarca e alcuni amici svelano un'alternativa. Questi ragazzi hanno creato un motore di ricerca su misura dedicato alla diagnosi delle malattie rare chiamato TrovaZebra , un nome basato sul gergo medico comune per una malattia rara. Dopo aver confrontato i risultati di questo motore con le stesse ricerche su Google, mostrano che è significativamente migliore nel restituire risultati pertinenti.

La salsa magica in FindZebra è l'indice che utilizza per cercare i risultati. Questi ragazzi hanno creato questo indice eseguendo la scansione di un insieme appositamente selezionato di database curati sulle malattie rare. Questi includono il Eredità mendeliana in linea in Man database, il Centro informazioni sulle malattie genetiche e rare e Orphanet .

Quindi usano lo strumento di recupero delle informazioni open source Indri per cercare questo indice tramite un sito Web con un'interfaccia di motore di ricerca convenzionale. Il risultato è Trova Zebra.

Infine, hanno confrontato i risultati delle ricerche su FindZebra con la stessa ricerca su Google applicata allo stesso set di dati limitato, una funzionalità possibile con le ricerche avanzate di Google. Dragusin e co affermano che i risultati di Google sono significativamente peggiori dei loro.

Ad esempio, su FindZebra la query di ricerca Ragazzo, nascita normale, deformità di entrambi gli alluci (articolazione mancante), sviluppo rapido di tumore osseo vicino alla colonna vertebrale e osteogenesi alla biopsia restituisce come primo risultato la diagnosi corretta di Fibrodisplasia ossificante progressiva. Tuttavia, questa diagnosi non compare affatto nei risultati di nessun tipo di ricerca su Google.

Ciò indica che l'algoritmo PageRank, o almeno il modo in cui Google lo ha ottimizzato, non è adatto a questo tipo di ricerca. La nostra scoperta, che FindZebra supera Google in generale per questo compito e soprattutto se limitato ai siti della nostra raccolta (Google Restricted), suggerisce che l'algoritmo di ranking di Google non è ottimale per l'attività in corso, concludono.

Sebbene sia ancora un progetto di ricerca, Dragusin e co hanno reso il loro motore di ricerca per le malattie rare disponibile pubblicamente su www.findzebra.com . Questo potrebbe chiaramente diventare uno strumento prezioso per la comunità medica.

Ciò che è meno chiaro, tuttavia, è come questo strumento verrà utilizzato dal grande pubblico. Il sito arriva con il messaggio abbandonato: Avvertimento! FindZebra è un progetto di ricerca e va utilizzato solo da professionisti medici.

FindZebra potrebbe ovviamente essere la carta di un ipocondriaco. D'altra parte, questo vale per qualsiasi dizionario medico.

Il pubblico informato visita sempre più i propri medici armati di informazioni dettagliate scaricate da Internet. Qualsiasi mossa per migliorare la qualità di queste informazioni deve sicuramente avere un valore significativo.

Rif: arxiv.org/abs/1303.3229 : FindZebra: un motore di ricerca per le malattie rare

nascondere