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Il carburante per missili per il Cancer Moonshot di Biden? Big Data
Se il vicepresidente Joe Biden è Colpo di luna del cancro sta davvero per raddoppia il ritmo dei progressi nella prevenzione, diagnosi e cura del cancro, saranno necessari molti più dati. Ciò significa che probabilmente avrà bisogno di più accordi di condivisione dei dati come quello annunciato al Cancer Moonshot Summit di oggi a Washington, DC, tra il National Cancer Institute e la Foundation Medicine, un'azienda biotecnologica che vende test che sequenziano i genomi tumorali.
Per accelerare i progressi, Biden ha chiamato per una maggiore condivisione dei dati e collaborazione tra i ricercatori sul cancro nel mondo accademico, nell'industria e nel governo. Foundation, che fornirà i profili genomici di tumori di 18.000 adulti dell'NCI, è la prima azienda a contribuire al nuovo Dati genomici comuni , un database pubblico e una piattaforma di analisi per la genomica del cancro. I nuovi dati raddoppiano le dimensioni del database, fondamentale per il progetto di Biden e per quello del presidente Obama Iniziativa di medicina di precisione . Aiuterà i ricercatori a studiare le anomalie genetiche osservate in molti tumori e potrebbe anche aiutare a creare nuove opportunità di trattamento.
Il vicepresidente Joe Biden sta guidando uno sforzo per accelerare la ricerca sul cancro.
Prima di oggi, il database dell'NCI conteneva informazioni sul sequenziamento dei tumori di circa 14.500 pazienti affetti da cancro, inclusi dati clinici su come rispondevano ai farmaci. Database di grandi dimensioni come questo potrebbero aiutare i ricercatori a comprendere meglio la natura dei tumori e individuare indizi sul motivo per cui alcuni tumori rispondono ai farmaci e altri no, e perché alcuni rispondono e poi ricadono.
Le informazioni della Fondazione non sono così complete; non includerà informazioni su come i pazienti hanno risposto ai farmaci. Tuttavia, è un'aggiunta drammatica alle risorse di dati esistenti dell'NCI, afferma Louis Staudt, direttore dell'NCI Centro per la genomica del cancro . Maggiore è il set di dati, maggiore è la possibilità che vengano scoperte nuove cose. Più che raddoppiando il numero di pazienti, aumenteremo notevolmente il potere esplicativo del database per la comprensione del cancro, afferma Staudt.
L'idea della medicina di precisione consiste nell'utilizzare quante più informazioni biologiche possibile per assicurarsi che i trattamenti siano adattati in modo più preciso agli individui e alle loro malattie. La sfida di fare questo per il cancro è che è tutt'altro che una singola malattia: ci sono almeno 200 moduli e molti altri sottotipi, definiti da anomalie specifiche nei genomi tumorali.
Alcuni pazienti hanno tumori con anomalie osservate solo in una frazione estremamente piccola di persone con quel tipo di cancro, dice Staudt, e in alcuni casi ci sono farmaci che funzionano contro quei tumori rari. Potrebbero esserci alterazioni altrettanto non comuni che non sono state ancora trovate e potrebbero rappresentare nuovi bersagli per i farmaci. L'aggiunta di più pazienti al database dell'NCI aumenta il suo potere di aiutarli a scoprirli.
Staudt spera che la donazione della Foundation Medicine ispiri mosse simili da parte di altri gruppi con set di dati che sarebbero preziosi per la genomica del cancro. L'NCI genererà anche i propri nuovi dati attraverso sperimentazioni cliniche innovative come NCI-MATCH , che si concentra sulla sperimentazione di terapie mirate su un gran numero di pazienti i cui tumori contengono anomalie specifiche.
Idealmente, ciò che serve è una raccolta che includa sia grandi quantità di informazioni sul sequenziamento dei pazienti che informazioni cliniche dettagliate, in particolare sui risultati della terapia, afferma Clifford Hudis, CEO dell'American Society of Clinical Oncology. Ciò significa che i medici dovranno migliorare l'immissione dei dati nelle cartelle cliniche e i dati dovranno essere leggibili dai computer, afferma.
Ma riunire questo tipo di informazioni sarà anche complicato dalle preoccupazioni sulla privacy dei pazienti e dalle leggi che regolano la condivisione di tali dati. E le entità commerciali non saranno sempre disposte a separarsi dai propri dati. La Fondazione afferma di averlo fatto in questo caso per accelerare la medicina di precisione. Forse questo ci dà un salto di qualità, dice Hudis.