Genoma da $ 1.000 in due ore entro il 2012, afferma il CEO di Ion Torrent

Il mitico genoma da 1.000 dollari è quasi alle porte, ha affermato Jonathan Rothberg, CEO della società di tecnologie di sequenziamento Ion Torrent, alla conferenza Emerging Technology del MIT. Se la sua previsione si avvererà, rappresenterà un sorprendente trionfo nel rapido sviluppo tecnologico. La velocità con cui il sequenziamento del genoma è diventato più conveniente è più veloce della legge di Moore . (Puoi leggere una domanda e risposta BAMBINI fatto con Rothberg all'inizio di quest'anno qui e un profilo della sua azienda qui).





Jonathan Rothberg, capo di Ion Torrent, parlando a EmTech 2011

A quest'ora, il prossimo anno, il sequenziamento dei genomi umani sarà rapido ed economico come il genoma batterico, ha affermato Rothberg. (In precedenza, aveva commentato che la sua azienda ora può eseguire un intero genoma batterico in circa due ore.)

Ero nella stanza il 19 ottobre quando lo disse, e avrei pensato che fosse pura arroganza se non fosse stato per l'incredibile esperienza di Rothberg in questo settore, dalla fondazione della società di sequenziamento di precedente generazione 454 Life Sciences alle recenti scoperte fatte con il la stessa tecnologia che propone ci porterà al genoma da $ 1.000.



Questa tecnologia, chiamata, chiamata the Macchina del genoma personale , è già utilizzato per determinare quali mutazioni sono presenti nei genomi dei tumori dei pazienti .

Il Personal Genome Maker si fa già vedere nei laboratori clinici, anche negli studi medici

La chiave di questa svolta, afferma Rothberg, è che il PGM non si basa sulla chimica umida convenzionale per sequenziare il DNA. Invece, funziona quasi interamente attraverso tecnologia convenzionale del microchip , il che significa che Ion Torrent sta sfruttando decenni di investimenti in transistor e chip convenzionali.



Allora, qual è l'età del genoma da $ 1.000? Fino a quando non sapremo con quali altri geni sono effettivamente correlati, per la maggior parte di noi non sarà così diverso dal presente.

Al momento non ci sono molte correlazioni tra quei 3 miliardi di paia di basi [del genoma umano] e i risultati o i farmaci, afferma Rothberg. Prevede che ci vorranno almeno 10 anni di esperimenti clinici con il sequenziamento completo del genoma per arrivare al punto in cui possiamo iniziare a sbloccarne il valore.

E ci vorranno 20 anni prima che comprendiamo il cancro allo stesso livello dell'HIV e possiamo trovare combinazioni di farmaci [su misura] per ogni individuo, dice Rothberg.



Puoi guardare un video completo del suo discorso sul sito EmTech di Tech Review.

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