Da basi a byte

Il costo del sequenziamento dei genomi umani sta precipitando: nei centri di genomica più avanzati, sta scendendo cinque volte più velocemente del costo dell'informatica. Sempre più persone ottengono il sequenziamento del proprio DNA da aziende e laboratori di ricerca alla ricerca di indizi sulla variazione genetica e sulle malattie.

Ma l'industria deve capire come archiviare a basso costo tutti i dati risultanti. Ciascuno dei 3,2 miliardi di coppie di basi del DNA in un genoma umano può essere codificato da due bit: 800 megabyte per l'intero genoma. Ma dati considerevoli di ogni base viene solitamente raccolta e i geni vengono spesso sequenziati molte volte per garantire l'accuratezza, quindi è normale risparmiare circa 100 gigabyte durante il sequenziamento di un genoma umano con una macchina prodotta dal leader del settore Illumina. Conservare così tanti dati su ogni persona sul pianeta richiederebbe lo stesso spazio di archiviazione digitale disponibile in tutto il mondo nel 2010.

Questa storia faceva parte del nostro numero di maggio 2012

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Il trucco, quindi, sarà quello di risparmiare di meno. Il genetista di Harvard George Church afferma che alla fine dovranno essere archiviate solo le differenze tra un genoma appena sequenziato e un genoma di riferimento. Tali informazioni potrebbero essere codificate in appena quattro megabyte. Allora il tuo genoma potrebbe essere solo un altro allegato di posta elettronica.

Grafica informativa di Infographics.com

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